「明明都是晚上上班，政府獎勵地區醫院的夜班費和醫學中心不一樣」，督保盟發言人滕西華指出，護理師半夜上班，疲憊程度一樣，若依層級區分，恐導致護理師從小醫院流向大醫院。
現行急性一般病床住院首日護理費，醫學中心1027點、區域醫院905點、地區醫院850點。社區醫院協會理事長朱益宏認為，不同層級醫院工作難度的差異，已反映在護理費給付上，「同樣取得執照，同樣犧牲睡眠、家庭，為什麼拿到的獎勵比較少」？
朱益宏說，護理師上夜班，大家都是8小時，並不是醫學中心工時較長。另醫學中心護病比較低，地區醫院要照顧更多人，誰比較辛苦？人人都應獲同工同酬保障，地區醫院護理師也非次等公民，衛福部的作法有違國際公約與憲法平等原則。
社區醫院協會會員紛紛反映，夜班費推動後，將湧現護理師離職潮，地區醫院缺工問題恐加劇。一名不具名地區醫院代表預估，自身醫院將有5～10％護理師出走，這項新制是把醫學中心的缺額推向地區醫院，「擺明不重視地區醫院」，分級醫療將受衝擊。
衛福部長薛瑞元則說，夜班費有層級之分，是考量醫學中心缺口大，且不同醫院夜班難度不一，在醫學中心值夜班，常會碰到緊急狀況，施行心肺復甦術的可能性高，也常需為手術做準備。
基層醫界人士指出，蔡總統2016年曾指出，與政府溝通不必溫良恭儉讓，「如果第一次聽不見，大聲一點；如果第二次再聽不見，你可以更大聲一點；第三次再聽不見的時候，你可以拍桌子」。該位不具名人士透露，地區醫院已在醞釀，將開會研議如何表達想法，看是要「拍桌」還是「翻桌」，呼籲政府迷途知返。
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